Il est admis que l'accessibilité des chromosomes chez les eucaryotes ou chez les procaryotes, le degré de décondensation du nucléoïde bactérien, sont des éléments à prendre en compte lors de l'analyse de leurs fonctions, en particulier lors de leur réplication ou de la variation de leur niveau d'expression. Cette hypothèse est restée relativement floue tant que l'on na pas disposé d'outils adaptés à une caractérisation précise de la localisation cellulaire des gènes et de la dynamique générale des domaines chromosomiques impliqués. Dans ce contexte, de très notables progrès techniques ont vu le jour au cours des dix dernières années. Mais il est d'ores et déjà clair que ces améliorations ne sont pas de même nature si l'on considère des cellules d'eucaryotes supérieurs, de levure ou bien des bactéries comme E.coli ou B.subtilis. Dans ces derniers cas, les objets beaucoup plus petits, ont bénéficié des ressources provenant d'une génétique performante. On examinera comment des notions au départ assez vagues comme celles de domaines d'ADN, chez les bactéries, ou de territoires chromosomiques chez les eucaryotes, ont trouvé peu à peu des justifications expérimentales. La comparaison portera essentiellement sur l'organisation des chromosomes en interphase et celle du chromoïde bactérien, lors de la régulation de l'expression génétique.
Notons que ces notions sont par essence dynamiques. Le recours à des marqueurs insérés dans un domaine donné de la chromatine en vue de la caractérisation de ses propriétés dynamiques requiert un formalisme élaboré en vue de l'interprétation des constantes de diffusion et, au plan expérimental, une observation de trajectoires d'égale précision dans les trois dimensions ainsi qu'une excellente connaissance de la structure des organelles cellulaires qui limitent ou orientent les processus de diffusion (par exemple les structures qui, comme les pores, servent d'ancrage aux territoires chromosomiques au niveau des membranes internes des noyaux). Il y a là - pour l'année du centenaire des célèbres publications d'Einstein dans le domaine de la diffusion - l'occasion dune confrontation entre physiciens de la matière molle et biologistes cellulaires.
